江苏高淳经济开发区地处长三角地区苏南板块，位于南京市高淳县城东郊，公路四通八达，宁高高速、芜太高速、宁宣高速、高望公路、芜太公路穿境而过；水路西进长江黄金水道，东连太湖水网，横贯高淳的芜申运河为三级航道；宁杭城际铁路、绕城轻轨已通过规划，交通便捷，物流顺畅。

江苏高淳经济开发区前身为江苏省高淳外向型农业综合开发区，于1995年10月经江苏省人民政府批准（苏政复 95号文件）设立。1995年11月，江苏省高淳外向型农业综合开发区管委会（管委会下设办公室）、江苏省高淳外向型农业资源综合开发总公司正式成立，实行两块牌子一套班子，并进行开发准备工作。1996年3月28日，县委、县政府在县招待所隆重举行“江苏省高淳外向型农业综合开发区”揭牌仪式暨经贸洽谈会。1998年7月，县委、县政府决定高淳外向型农业综合开发区管委会与淳溪镇人民政府“区政合一”，两块牌子、一套班子，实行省级开发区的牌子、功能定位、现有规划思路“三不变”。1999年11月28日，高淳外向型农业综合开发区管委会与淳溪镇人民政府分离，与高淳县对外经济贸易委员会合署，实行一套班子，两块牌子。